探究生命起源能(néng)量来源
你或许听过一种说法:地球上的每一种生物(wù)都来自LUCA。
LUCA的全称是“最后一个普遍的共同祖先”,这是一种早期生命形式。目前普遍认為(wèi),LUCA生活在至少35亿年前,甚至更久遠(yuǎn)的过去。LUCA并不是最早的生命,然而让它变得与众不同的是,它被认為(wèi)是现存所有(yǒu)生物(wù)的最后一个共同祖先,换言之,只有(yǒu)LUCA的直系亲属最终存活了下来,并繁衍出了如今的地球生物(wù)圈。
对于LUCA甚至更早的生命来说,目前所有(yǒu)关于生命起源的理(lǐ)论都认為(wèi),需要一种能(néng)量来源来促进它们原始的化學(xué)反应发生,推动生物(wù)新(xīn)陈代謝(xiè)的出现。但我们仍然不清楚,这种能(néng)量来源究竟是什么?生命最初的化學(xué)反应又(yòu)是如何开始的?
近日,在一项发表在《微生物(wù)學(xué)前沿》的新(xīn)研究中,一组科(kē)學(xué)家重建出了LUCA的新(xīn)陈代謝(xiè)并发现,原始生命用(yòng)来拼凑细胞分(fēn)子零件的几乎所有(yǒu)化學(xué)步骤都是放能(néng)反应。他(tā)们认為(wèi),我们一直在寻找的那种合成生命的基本零件所需的能(néng)量,恰恰就来自代謝(xiè)本身。整个过程还有(yǒu)一种基本的起始化合物(wù)必不可(kě)少,那就是氢气(H2)。
研究团队一直在探索,早期地球上的生命是如何以及在哪里产生的。他(tā)们的方法既包括实验,也包含计算性的研究。
比如,科(kē)學(xué)家会在实验室中进行化學(xué)实验,利用(yòng)类似海底热液喷口发现的催化和环境条件,研究氢气和二氧化碳之间的反应。此外,他(tā)们还在计算机上开发了一种形式的“分(fēn)子考古學(xué)”,帮助寻找原始生命的许多(duō)不同痕迹,这些痕迹被保存在现代细胞的蛋白质、DNA和化學(xué)反应中。
在这项最新(xīn)的研究中,他(tā)们巧妙地没有(yǒu)选择研究基因等其他(tā)方面,而是关注了生命的化學(xué)反应本身所包含的信息。
在大约40亿年前,代謝(xiè)反应刚开始出现时,还不存在蛋白质或者酶来催化反应,因為(wèi)这些分(fēn)子还没有(yǒu)进化出来。代謝(xiè)一定来自可(kě)以在环境中发生的反应,也许还有(yǒu)某些无机催化剂的帮助。
但是,无论有(yǒu)没有(yǒu)催化剂,為(wèi)了进一步发展,反应必须释放能(néng)量。过往的文(wén)献中已经有(yǒu)很(hěn)多(duō)关于代謝(xiè)能(néng)量可(kě)能(néng)来源的想法,但似乎还没什么人研究过代謝(xiè)的反应本身。
研究人员制作了一份目录,其中囊括了现代细胞中简单而古老的细胞(细菌和古菌)用(yòng)来构建生命基本零件的402个反应,这些所谓的基本零件包括20种氨基酸、DNA和RNA的碱基,还有(yǒu)18种代謝(xiè)所必需的维生素(辅因子)。
这些反应是“高度保守”的,换句话说,它们可(kě)能(néng)自从约40亿年前生命起源以来几乎就没有(yǒu)改变过。它们是所有(yǒu)细胞共有(yǒu)的,因此也应当存在于LUCA中。这些反应可(kě)以揭示原始生命如何处理(lǐ)代謝(xiè)中的能(néng)量,以及它从哪里获得使生命的化學(xué)反应进一步发展所需的能(néng)量。
团队首先借助计算机程序模拟了不同的环境条件,研究了402个反应的能(néng)量特性,因為(wèi)环境往往对反应能(néng)量产生着重要影响。研究涉及的环境条件从酸性到碱性(pH 1到14),温度从25跨越到100°C,还纳入了不同反应物(wù)和产物(wù)的相对量等。
科(kē)學(xué)家还格外仔细地研究了氢气的能(néng)量角色。因為(wèi)反应首先需要氢气,让二氧化碳中的碳进入代謝(xiè)。
LUCA的新(xīn)陈代謝(xiè)。团队研究了生命分(fēn)子基本构件的生物(wù)合成所需的402个生物(wù)化學(xué)反应。每个圆圈代表一个反应,颜色则对应每个反应释放的能(néng)量。绿色表示释放能(néng)量,紫色则表示需要能(néng)量。| 图片来源:HHU / Jessica Wimmer
结果显示,LUCA的新(xīn)陈代謝(xiè)其实并不需要外部的能(néng)量来源,包括紫外線(xiàn)、陨击、火山(shān)喷发或者放射性等来源可(kě)能(néng)都不是必需的。相反,在许多(duō)现代海底热液喷口附近的典型环境中,代謝(xiè)反应所需的能(néng)量来自代謝(xiè)本身。换句话说,LUCA生命的能(néng)量源自生命本身。
他(tā)们观察到,最佳能(néng)量条件落在了pH在9左右的碱性条件、温度约80℃的环境中,同时需要氢气来固定二氧化碳。事实上,这差不多(duō)正是我们在大西洋中部的一个产生氢气的热液场观察到的典型情况。在那样的环境中,大约95-97%的LUCA的代謝(xiè)反应可(kě)以自发进行。
在热液系统所处的无尽黑暗中,氢气就好比一种“化學(xué)阳光”,為(wèi)暗无天日的地方带去了生机。
研究的第一作者Jessica Wimmer表示:“关于生命起源的能(néng)量来源,我们可(kě)以说,纯化學(xué)能(néng)已经足够了。或许并不需要阳光,不需要陨石,不需要紫外線(xiàn),只要氢气和二氧化碳,再加上一些氨和盐。”
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